O Museu Nacional de Soares dos Reis está situado numa zona central da cidade, próximo do Hospital Geral de Santo António e do Palácio de Cristal.

Carro
É fácil chegar de carro a partir de qualquer ponto da cidade. Encontrando-se na Praça Mouzinho de Albuquerque (Rotunda da Boavista) deve seguir pela Rua Júlio Dinis até à Rua D. Manuel II.
Se partir da Avenida dos Aliados deve circular no sentido da Praça Filipa de Lencastre, subir pela Rua de Ceuta, seguir pela Rua José Falcão, Praça Guilherme Gomes Fernandes, Praça Gomes Teixeira (também conhecida por Praça dos Leões), Largo Professor Abel Salazar, Rua Clemente Menéres e finalmente Rua D. Manuel II ou, então, utilizar o Túnel dos Almadas, que tem inicio na Praça Filipa de Lencastre e saída para esta rua.

Comboio
Se utilizar o comboio ao chegar à estação de Campanhã pode apanhar um autocarro (STCP - 207) no terminal junto à estação. Encontrando-se em Campanhã pode optar por fazer o transbordo e vir até à estação de S. Bento. A partir de S. Bento chegará em 20 minutos a pé ao Museu, subindo a Rua dos Clérigos, Rua dos Carmelitas, Praça Gomes Teixeira, Largo Professor Abel Salazar, Jardim do Carregal e Rua D. Manuel II. Se preferir pode apanhar um dos autocarros que tem paragem na Avenida dos Aliados.

Transportes
Dependendo do local da cidade existem várias linhas do STCP que têm paragem perto do museu (200, 207, 302 300,601, 602, 507, 501, 201). Pode utilizar o Metro, mas combinado com outro transporte das linhas do STCP.

Estacionamento
O museu não possui estacionamento próprio mas nas imediações existem diversos parques de estacionamento.
Os autocarros escolares podem parar em frente ao museu o tempo suficiente para a saída dos passageiros, mas não podem permanecer. Para evitar confusões deverá ser combinada com o motorista a hora para recolha dos passageiros. O parque do Palácio de Cristal poderá ser utilizado para estacionamento mediante contacto do museu aquando da marcação da visita.

BICICLETAS
O Museu possui, junto ao portão de entrada para a Cafetaria, lugar para estacionamento de 6 bicicletas.